Herøy kommune er organisert som en to-nivåkommune.  Det vil si at lederne av de ulike enhetene i kommunen er direkte underlagt kommunedirektøren.

Kommunenes høyeste administrative organ er kommunedirektørens ledergruppe, som består av:

  • Kommunedirektør - John Arne Andersen
  • Kommunalleder 1 - Siv Nilsen
  • Kommunalleder 2 - Caroline Asphaug
  • Kommunalleder 3 - Morten Hanssen
  • Enhetsleder for Herøy barnehage - Line Olsen
  • Enhetsleder for Herøy skole - Lars Olav Mogård-Larsen
  • Enhetsleder for hjemmetjenesten - Wenche Sæthre Jørgensen
  • Enhetsleder for miljøtjenesten - Roger Falch Iversen
  • Enhetsleder for institusjon - Marit Reitan Kjemsås
  • Enhetsleder for driftsavdelingen - 
  • Leder for NAV Herøy/Dønna - May-Brith Pedersen

Kommunedirektørens ledergruppe har faste møter minst en gang per måned.